Rin Tsuchimi, un lycéen japonais normal, est l'objet de l'attention de diverses filles. Dans le monde de Shuffle!, les humains vivent en harmonie avec les dieux (qui ont les oreilles légèrement pointues) et les diables (qui ont de grandes oreilles pointues). En dépit de leurs connotations positives ou négatives, les deux races sont de nature bonne et gentille. Rin se retrouve fiancé potentiel de Lisianthus et de Nerine, respectivement fille du roi des dieux et fille du roi des diables, qui viennent d'arriver dans son lycée. En plus de cela, il est aimé de Kaede, son amie d'enfance, d'Asa, une élève plus âgée, et de l'étrange et réservée Primula. Au cours du jeu, Rin va tomber amoureux de l'une des cinq filles et terminer le jeu avec elle.

Imaginer qu'il existe des êtres vivants qui sont à la base de l'existence même et que ces êtres vivants ne peuvent être vus que par certains humains. Ils peuvent prendre toutes les formes possibles et peuvent entrer en contact avec les humains pour leur nuire ou pour leur garantir des pouvoirs surnaturels. Ces bestioles s'appellent les Mushi et certains hommes qui parviennent à les distinguer essaient de les étudier: on les appelle les Mushishi. C'est le cas de Ginko qui voyage à travers le Japon pour dépanner certaines personnes qui entrent en contact avec ces Mushi qui leur posent problème.

1er épisode:

2è épisode:

3è épisode:

Marmalade Boy continue ICI ! 

Yûgi Moto est un garçon dont le point faible est d'être trop gentil. Il se fait continuellement embêter par les autres élèves de son école. Un jour il reçoit de son grand père un objet trouvé lors d'une fouille en Égypte : le puzzle du millénium. Nul n'était auparavant parvenu à reconstituer cet antique objet, mais le jeune Yûgi réussit finalement à l'assembler.

À cet instant, est libéré l'esprit d'un ancien pharaon d'Égypte, enfermé jusqu'alors dans le puzzle, qui viendra habiter le corps de Yûgi. C'est un être sûr de lui et ne reculant jamais devant rien. Cependant, peu de gens sont au courant de la vérité. Le pharaon est spécialiste de tous les types de jeu. Il est d'ailleurs le maître du jeu des ténèbres. Mais pour une raison inconnue, il ne se souvient pas de son passé ni qui il est exactement.

Après de successifs affrontements contre son grand ennemi Seto Kaiba au duel de monstres, il découvre petit à petit sa véritable identité, celle d'un pharaon qui a vécu il y a 3000 ans, et dont l'esprit a été scellé dans le puzzle du millénium. La clé de sa victoire contre les forces maléfiques du temps où il régnait sur l'Égypte est en fait son propre nom. Il s'agit du pharaon Atem.